Data Science Center
Data Science Center (DSC)
Il DSC è una struttura interna che offre supporto collaborativo per un'ampia gamma di analisi dei dati relativi alla ricerca scientifica su piccola e larga scala.
Nasce dall’impegno congiunto di diverse unità operative e integra competenze di bioinformatica, biologia, epidemiologia, ingegneria, matematica e statistica, con l’obiettivo di applicare sofisticate metodologie analitiche a dati clinici, omici, neurofisiologici e di imaging.
Il DSC mette a disposizione di tutto l’Istituto le competenze analitiche di varie figure professionali per favorire collaborazioni interne e per supportare i ricercatori nelle diverse fasi di avanzamento dei progetti, a partire dalla costruzione del disegno di studio, contribuendo attivamente all’analisi e all’interpretazione dei dati.
Il DSC ad oggi offre supporto analitico in diverse aree:
Analisi di immagini
- Analisi quantitative e di machine learning di immagini acquisite mediante tecniche avanzate di Risonanza Magnetica per l'identificazione di biomarcatori diagnostici e prognostici precoci di malattia, per la valutazione dell’efficacia degli approcci terapeutici e per la comprensione dei meccanismi anatomofunzionali; integrazione con dati clinici e genetici.
- Deep learning su bioimmagini con lo scopo di eseguire task di segmentazione, identificazione e classificazione di elementi specifici di interesse medico.
Analisi di segnali neurofisiologici
- Analisi di segnali neurofisiologici spontanei ed evocati (tempofrequenza, connettività, classificazione) per la valutazione di meccanismi fisiopatologici e di risposta a trattamenti; magnetic source imaging per identificazione di sorgenti di attività corticale fisiologica e patologica.
- Implementazione di procedure di stimolazione e integrazione multimodale.
Biostatistica
- Analisi statistiche per dati sperimentali e studi epidemiologici osservazionali, revisioni sistematiche e metaanalisi.
Genomica/Trascrittomica
- Analisi bioinformatica applicata alla genomica sia per DNA nucleare, che mitocondriale, per approcci di sequenziamento target o dell’esoma.
- Analisi bioinformatica applicata alla trascrittomica sia per RNA messaggero, che RNA non codificante (miRNA, long non coding).
- Studi di associazione genome-wide con tecnologia di genotyping e modelli di predizione del rischio.
Neuroepidemiologia
- Validazione di misure di outcome clinico, incluse le misure patientreported (PROMs)
- Analisi psicometrica: validità, consistenza interna, riproducibilità, responsività
- Traduzione-adattamento ed armonizzazione di PROMs
- Studi qualitativi e a metodologia mista
- Pianificazione, conduzione e analisi di colloqui semi-strutturati e gruppi di discussione
- Delphi e altre metodologie di consenso
- Disegno, conduzione e analisi di trial clinici su interventi sanitari complessi
- Analisi di processo
Le candidature alla partecipazione sono aperte a tutto l’Istituto e a collaborazioni esterne in convenzione.
Team
Di seguito l’elenco in ordine alfabetico delle persone attualmente coinvolte, divise per area di applicazione:
Analisi di immagini
- Domenico Aquino (Neuroradiologia)
- Pierangela Bruno (Dipartimento di Matematica e Informatica, Università della Calabria)
- Anna Nigri (Neuroradiologia)
- Riccardo Pascuzzo (Neuroradiologia)
Analisi di segnali neurofisiologici
- Dunja Duran (Epilettologia clinica e sperimentale)
- Elisa Visani (Epilettologia clinica e sperimentale)
Genomica/Trascrittomica
- Andrea Legati (Genetica medica e neurogenetica)
- Stefania Magri (Genetica medica e neurogenetica)
- Linda Maldera (Neuroalgologia)
- Elkadia Mehmeti (Neuroalgologia)
- Erika Salvi (Neuroalgologia)
- Irene Sambruni (Neuro-oncologia molecolare)
Neuroepidemiologia
- Andrea Giordano (Neuroepidemiologia)